Amazon SageMaker ノートブックインスタンスの R 環境に rJDBC パッケージをインストールする方法を教えてください。

解決方法

rJDBC パッケージを SageMaker ノートブックインスタンスの R 環境にインストールするには、次の操作を行います。

1.    SageMaker コンソールを開きます。

2.    ナビゲーションペインで、[Notebook (ノートブック) を選択し、[Notebook instances] (ノートブックインスタンス) を選択します。

3.    rJDBC パッケージをインストールするノートブックインスタンスを選択します。

4.    [Open JupyterLab] (JupyterLab を開く) を選択します。ノートブックがインターネットに接続できることを確認します。この接続は、Anaconda リポジトリから rJDBC パッケージをダウンロードするために必要です。

5.    新しいターミナルを開き、次のコマンドを所定の順序で実行します。

source activate R

conda install -y -c r r-rjdbc

conda deactivate

6.    R カーネルを使用して新しい Jupyter Notebook を開きます。

7.    セルで以下のコマンドを実行します。

dyn.load('/home/ec2-user/anaconda3/envs/R/lib/jvm/lib/server/libjvm.so')

8.    rJDBC パッケージがインストールされていることを確認するには、Jupyter Notebook で以下のコマンドを実行します。

library(RJDBC)

出力は次のようになります。

Loading required package: DBI

Loading required package: rJava

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関連情報

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ノートブックインスタンスに外部ライブラリとカーネルをインストールする