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EC2が起動していてもAMIの取得は可能です。
再起動を行うと、メモリ上のデータやキャッシュがディスクに書き込まれ、ファイルシステムの整合性が保たれます。
つまり、以下のブログで紹介されているようなことが起きないようにするために再起動を行っています。
https://qiita.com/mechamogera/items/60a23cf5a52f8ebd8417
再起動自体はオプションなので、AMIの作成時に再起動のチェックを外せば再起動が行われないでAMIが取得されます。
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早速のご回答ありがとうございました!わかりやすくご説明していただき助かりました。 イメージ作成時の運用において、再起動をする前提で稼働中にAMIを取得する手順で行います。