ユーザーデータ処理中にS3 cpコマンドがエラーになる

インスタンスにSSH接続して同じコマンドを叩くとダウンロードは正常にできる

その際にインスタンスプロファイルの認証情報を使用していることは確認済みでしょうか。

$ aws configure list

上記コマンドを実行した際に認証情報がインスタンスプロファイルに設定されている場合、以下のように出力されるようです。

 Name                Value                      Type           Location  
 ----                 -----                      ----           --------  
 profile                <not set>             None          None  

access_key ****************YVEQ iam-role
secret_key ****************2a9N iam-role
region <not set> None None

https://aws.amazon.com/jp/premiumsupport/knowledge-center/s3-locate-credentials-error/