여러개의 EC2에 보안그룹을 지정하고 싶습니다.

서브넷 단위로 보안을 설정하기 위해서는 Network ACL을 사용할 수 있습니다. https://docs.aws.amazon.com/ko_kr/vpc/latest/userguide/vpc-network-acls.html

네트워크 액세스 제어 목록(ACL)은 서브넷 수준에서 특정 인바운드 또는 아웃바운드 트래픽을 허용하거나 거부합니다. VPC에 대한 기본 네트워크 ACL을 사용하거나 보안 그룹에 대한 규칙과 유사한 규칙을 사용하여 VPC에 대한 사용자 Network ACL을 생성하여 VPC에 보안 계층을 추가할 수 있습니다.