CloudWatchを使ってEC2上のゾンビプロセスの発生を監視することは可能ですか？

ゾンビプロセスになっているものをカウント、CloudWatchメトリクスへ登録するようなシェルスクリプトなどを作成して、cronで定期実行すれば可能だと思います。
例えばですが以下のようなシェルスクリプトで可能だと思います。
以下のシェルスクリプトではpsコマンドのステータスがZになっているものを取ってきてwcで行数をカウントしています。
その結果をCloudWatchメトリクスに登録するようなスクリプトです。

#!/bin/bash

count=`ps aux | grep 'Z' | grep -v 'grep' | grep -v 'USER' | wc -l`
aws cloudwatch put-metric-data --namespace "名前空間" --metric-name "メトリクス名" --value $count --region "使用しているリージョン"